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奥林巴斯CX43生物显微镜的应用多指其在生物领域中的使用，在生物领域中，CX43可以用来看一些透明或半透明的液体和粉末状的物体，主要用于微生物的检查，还有医院里的常规检查。也可以用在实验室中，用来观察生物切片、生物细胞、细菌以及活体组织培养等分裂过程的观察和研究。

作为生物显微镜，奥林巴斯CX43可谓舒适、高效的满足用户在生物领域的应用，CX43照明均匀，色温恒定，采用LED照明，色温实现日光效果，在样品的自然色条件下即可进行观察。奥林巴斯CX43生物显微镜也是舒适高质量的显微镜，CX43的机架设计满足人体工学的要求，是操作更便捷，效率更高。在使用奥林巴斯CX43时，无需移动聚光器顶侧镜头，即可实现4X至100X的放大倍率更换。2X的放大倍率也可以通放置目镜和聚光器转盘至2X的位置来实现。低位配置的换镜旋座能够让操作者在调焦过程中使用最少的肢体动作快速地更换物镜，在长时间的观察中，极大地提高了工作效率。

为了符合人体工学的需求，以及将工作效率最大化体现，全新的生物显微镜奥林巴斯Olympus cx43将人手与显微镜镜架的控制旋钮进行了很好的匹配。此外操作者在使用一只手调节焦距和载物台的时候，另一只手可以迅速放置样品，从而使得操作动作最小化，减少了在使用上的操作时间。